| 代 | 氏名 | 在職期間 |
|---|---|---|
| 初代 | 牧 實 | 昭和27年9月~昭和28年3月 |
| 第2代 | 西山 勗 | 昭和28年4月~昭和50年3月 |
| 第3代 | 大関 英明 | 平成50年4月~昭和57年3月 |
| 第4代 | 宇治 壽康 | 昭和57年4月~平成6年3月 |
| 第5代 | 鬼塚 義行 | 平成6年4月~平成12年3月 |
| 第6代 | 堤 直文 | 平成12年4月~平成21年3月 |
| 第7代 | 久々山芳文 | 平成21年4月~平成23年3月 |
| 第8代 | 浦田 健二 | 平成23年4月~令和元年6月 |
| 第9代 | 伊藤 明彦 | 令和元年7月~令和7年6月 |
| 第10代 | 牛島 隆 | 令和7年7月~現在 |
※本連盟規約の改正により、平成23年4月1日より、熊本県歯科医師連盟の長である連盟長の役職名が「会長」へと変更になりました。